Является федеральным государственным органом, организующим подготовку и проведение выборов, референдумов в РФ в соответствии с компетенцией, установленной Федеральным законом от 12 июня 2002 № 67-ФЗ «Об основных гарантиях избирательных прав и права на участие в референдуме граждан Российской Федерации». Ц. и. к. действует на постоянной основе и является юридическим лицом. Срок полномочий Ц. и. к. составляет 4 года. Ц. и. к. является комиссией, организующей выборы в федеральные органы государственной власти, а также комиссией референдума, организующей референдум РФ. Ц. и. к. состоит из 15 членов. 5 членов Ц. и. к. назначаются ГД из числа кандидатур, предложенных фракциями, иными депутатскими объединениями в ГД, депутатами ГД (от 1 депутатского объединения может быть назначено не более 1 члена комиссии). 5 членов Ц. и. к. назначаются СФ из числа кандидатур, предложенных парламентами субъектов РФ и высшими должностными лицами субъектов РФ. 5 членов Ц. и. к. назначаются Президентом РФ. Члены Ц. и. к. должны иметь высшее профессиональное образование. Председатель Ц. и. к. избирается членами Ц. и. к. из своего состава тайным голосованием.
К полномочиям Ц. и. к. относятся: осуществление контроля за соблюдением избирательных прав и права на участие в референдуме граждан РФ; организация разработки нормативов технологического оборудования для участковых комиссий, утверждение этих нормативов и осуществление контроля за их соблюдением, размещение заказа на производство технологического оборудования; обеспечение реализации мероприятий, связанных с подготовкой и проведением выборов, референдумов, развитием избирательной системы в РФ, внедрением, эксплуатацией и развитием средств автоматизации, правовым обучением избирателей, профессиональной подготовкой членов комиссий, изданием необходимой печатной продукции; осуществление мер по организации единого порядка распределения эфирного времени и печатной площади между зарегистрированными кандидатами, избирательными объединениями для проведения предвыборной агитации; оказание правовой, методической, организационно-технической помощи комиссиям; рассмотрение жалоб на решения и действия (бездействие) нижестоящих комиссий и принятие по ним мотивированных решений; осуществление иных полномочий, установленных федеральными законами. Кроме того, Ц. и. к. рассматривает жалобы на решения и действия (бездействие) избирательных комиссий субъектов РФ и их должностных лиц, нарушающие избирательные права граждан и право граждан на участие в референдуме при проведении выборов в органы государственной власти субъектов РФ, референдумов субъектов РФ, выборов в органы местного самоуправления, местных референдумов. Ц. и. к. совместно с избирательными комиссиями субъектов РФ осуществляет проверку сводных финансовых отчетов и сведений о поступлении и расходовании средств политических партий, контроль за источниками и размерами имущества, получаемого политическими партиями в виде вступительных и членских взносов, пожертвований граждан и юридических лиц, информирует граждан о результатах этих проверок. Ц. и. к. вправе давать заключения о соответствии законов и иных нормативных правовых актов субъектов РФ федеральным законам о выборах.